1997年1月，蔡兆雄任院长，王存田任党委书记，张世海任副书记。
1997年3月，行署专员马铁山同志来我院现场办公，解決医院发展的资金可题;张志强、王万富任副院长。
1997年4月，我院门诊楼、东住院楼扩建工程、西沙分院工程开工;王毓斌同志当选为省先进工作者、省党代会代表。
1997年7月，投资100万元购买东芝800毫安X光机;我院率先在全省引进微机网络管理系统，使医院科学管理工作跃上一个新台阶。
1997年8月，樊耀斗、班世明赴欧洲七国进行学术交流；省卫生厅黄立勋副厅长率全省三级医院院长及省厅有关领导参加的医政工作会议代表来我院视察工作，对计算机管理系统给予高度评价；门诊楼扩建工程竣工
1998年2月，张树凡同志任纪检书记。
1998年5月，刘志国同志任工会主席
1998年6月，“榆林地区北六县(市)急救中心”在我院成立，开通了专线急救电话:3269999。
1998年8月，陕、蒙、晋、宁“医院影像学学术硏讨会”在我院召开。共有4省区近百名院长参加是我院建院史上自办的最大的学术会议。
1998年12月，西沙分院开诊；我院引进螺旋CT投入使用。
1999年4月，向社会公开八项服务承诺
1999年5月，第四军医大学唐都医院医疗队来我院进行学术交流和临床指导；引C型臂，成立介入治疗中心。
1999年8月，我院被省政府指定为医疗鉴定复审单位
1999年10月，我院被国际计划救治中心确定为定点医院。
1999年11月，杨东明同志任副院长；投资65万元购买全自动生化分析仪投入使用。
2000年3月，中华慈善总会专家委员会确定我院为唇腭裂矫正手术定点医院。
2000年5月，佳县发生“5·26”特大交通事故，我院派出医疗队进行抢救。
2000年6月，投资78万元购买的全区唯一的椎间盘镜投入使用。
2000年7月，榆林撤地设市，医院改称为“榆林市第二医院”；投资55万元，购买了电子胃镜诊断系统。
2000年8月，《中国全民卫生保健网络》榆林中心站在我院开通，远程会诊系统开诊；由医院扶贫支助的吴堡县岔上村“希望小学”建成。
2000年10月，我院与苏州二院建立帮扶协助关系，并派出人员参观学习。
2001年7月，投资45万元，引进体内伽马刀全套装置并成功应用于临床。
2001年8月，苏州二院支助的核磁共振在我院投入使用。
2001年7月16日，参与“横山马房事件”紧急救援工作。
2001年8月4日，省卫生厅范兵副厅长来我院检查工作。
2001年8月4日，省卫生厅范兵副厅长来我院检查工作
2003年7月，与全国人民一起共同抗击非典，在行动中二院人迎难而上，敢打敢拼，取得了抗击非典的伟大胜利，被中共榆林市委授予“抗击非典先进单位”
2004年10月5日，举行西京医院心血管外科与我院协作医院揭牌仪式。
2004年12月25日，榆林市老医协成立十周年暨二OO四年年会在我院召开。